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labase:medecine-autonomie:biblio-masks [2020/04/27 17:48] geronimo |
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====== Biblio scientifique relative au SARS-cov-2 ====== | ====== Biblio scientifique relative au SARS-cov-2 ====== |
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| Voir notre librairie [[+tab|https://www.zotero.org/groups/2462558/bib/library|Zotero]]. Dans les notes de chaque article, nous sommes priés de donner les infos importantes pour nous. Par ex : tests expérimentaux, quels types de virus/bactéries/particules, etc. Si l'article n'a pas d'intérêt, noter "zz-" devant le nom du premier auteur. |
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| Voir notamment les [[+tab|https://scholar.google.com/scholar?hl=fr&as_sdt=2005&sciodt=0%2C5&cites=14573243267835545576&scipsc=1&q=efficacy&btnG=|articles qui citent Davies et al 2013]] |
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===== Caractéristiques du SARS-cov-2 ===== | ===== Caractéristiques du SARS-cov-2 ===== |
* Survie dans l'air & sur matériels. Voir Van Dormalen et al 2020 NEJM : [[+tab|https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmc2004973|Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1]]. | * Survie dans l'air & sur matériels. Voir Van Dormalen et al 2020 NEJM : [[+tab|https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmc2004973|Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1]]. |
{{ :labase:medecine-autonomie:van_doremalen_20_nejm_fig1a.jpg?300 |}} | {{:labase:medecine-autonomie:van_doremalen_20_nejm_fig1a.jpg?300 |}} |
{{ :labase:medecine-autonomie:van_doremalen_et_al_nejm_fig_1c.jpg?300 |}} | {{:labase:medecine-autonomie:van_doremalen_et_al_nejm_fig_1c.jpg?300 |}} |
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| === Dynamique de l'infection === |
| * Histoire naturelle de la maladie (image très synthétique sortie du documentaire "[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=iVH9GJzkxGs&feature=emb_logo|penser la maladie]] (1)" |
| {{:labase:medecine-autonomie:capture_du_2020-04-28_13-33-10.jpg?200 |}} |
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| === Mortalité === |
| * Verity et al 2020 Lancet Inf. Dis. "[[+tab|https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1473309920302437#fig3|Estimates of the severity of coronavirus disease 2019: a model-based analysis]]" |
| {{:labase:medecine-autonomie:verity_et_al_2020_lancet_inf_dis_-_fig_3_estimates_of_case_fatality_ratio_by_age.jpg?200 |}} |
===== Transmission des particules virales ===== | ===== Transmission des particules virales ===== |
Voir la série de présentations youtube de Linsey Marr intitulé "Transmission of Viruses in Droplets and Aerosols" (en anglais)([[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=dD1gKaaQg6k&t=385s|1]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=JaN2PMgBQfI|2]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=9FqnnTKSAzU|3]]- [[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=rCRdtTMHNXE|4]] ) | Voir la série de présentations youtube de Linsey Marr intitulé "Transmission of Viruses in Droplets and Aerosols" (en anglais)([[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=dD1gKaaQg6k&t=385s|1]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=JaN2PMgBQfI|2]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=9FqnnTKSAzU|3]]- [[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=rCRdtTMHNXE|4]] ) |
Il existe plusieurs types de modes de transmission des virus : | Il existe plusieurs types de modes de transmission des virus : |
* par vecteurs (types moustiques) -- ce n'est pas le cas du SARScov2 mais plutôt de la Dengue, Zika, Chikiungunia, etc | * par vecteurs (types moustiques) -- ce n'est pas le cas du SARScov2 mais plutôt de la Dengue, Zika, Chikiungunia, etc |
* par contact directs (les gens se touchent) | * par contact direct (les gens se touchent) |
* par contacts indirects (via des objets comme des portes, ballons, etc) | * par contact indirect (via des objets comme des portes, ballons, etc) |
* via des gouttelettes (supérieurs à 5 µm) -- portée de 2 mètres | * par gouttelette (supérieurs à 5 µm) -- portée de 2 mètres |
* via des aérosols (gouttelettes inférieures à 5 µm) -- portée de plusieurs mètres | * par aérosol (gouttelette inférieures à 5 µm) -- portée de plusieurs mètres |
La probabilité de transmission de virus aéroportés (gouttellettes ou aérosols) est importante entre 0 et 1,5m : voir l'article de Liu et al 2017 Indoor Air "[[+tab|https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ina.12314?casa_token=hPt_zItdzOEAAAAA%3Alh_3nUFCNDzmGUgOWUGIUxyaAS8KDX89WucYdjLd4qbfxt-I8srEKruLNC7VWU6B8ahGtNbSEuN6i60|Short‐range airborne transmission of expiratory droplets between two people]]" | La probabilité de transmission de virus aéroportés (gouttellettes ou aérosols) est importante entre 0 et 1,5m : voir l'article de Liu et al 2017 Indoor Air "[[+tab|https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ina.12314?casa_token=hPt_zItdzOEAAAAA%3Alh_3nUFCNDzmGUgOWUGIUxyaAS8KDX89WucYdjLd4qbfxt-I8srEKruLNC7VWU6B8ahGtNbSEuN6i60|Short‐range airborne transmission of expiratory droplets between two people]]" |
{{ :labase:medecine-autonomie:liu_et_al_2017_indoor_air_-fig1.jpg?200 |}} | {{ :labase:medecine-autonomie:liu_et_al_2017_indoor_air_-fig1.jpg?200 |}} |
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Linsey Marr cite les articles suivants : | |
* Johnson et al 2011 : [[+tab|http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021850211001200|Modality of human expired aerosol size distributions]] : les gouttelettes font une taille de 0.8-1 µm lorsqu'on respire (ou tousse) | * Johnson et al 2011 : [[+tab|http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021850211001200|Modality of human expired aerosol size distributions]] : les gouttelettes font une taille de 0.8-1 µm lorsqu'on respire (ou tousse) |
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| La désactivation des virus une fois dans l'atmosphère se fait au cours de trois processus : |
| * dépôt |
| * ventilation vers l'extérieur |
| * inactivation |
| La désactivation dépend de la température, ainsi que de l'humidité relative (%RH). Plus la RH est forte, plus les grosse gouttelettes vont rester grosses et plus le dépôt sera fort. Voir les résultats de Yang & Marr 2011 PLoS One "[[+tab|https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0021481|Dynamics of Airborne Influenza A Viruses Indoors and Dependence on Humidity]]" |
| {{ :labase:medecine-autonomie:yang_marr_2011_plos_one.jpg?200 |}} |
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===== Efficacité des masques ===== | ===== Efficacité des masques ===== |
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Voir notre librairie [[+tab|https://www.zotero.org/groups/2462558/bib/library|Zotero]]. Dans les notes de chaque article, nous sommes priés de donner les infos importantes pour nous. Par ex : tests expérimentaux, quels types de virus/bactéries/particules, etc. Si l'article n'a pas d'intérêt, noter "zz-" devant le nom du premier auteur. | |
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Voir notamment les [[+tab|https://scholar.google.com/scholar?hl=fr&as_sdt=2005&sciodt=0%2C5&cites=14573243267835545576&scipsc=1&q=efficacy&btnG=|articles qui citent Davies et al 2013]] | |
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Pour la filtration, il y a plusieurs mécanismes (voir [[+tab|https://www.mdpi.com/2079-4991/8/6/447|Bulejko 2018]]): | Pour la filtration, il y a plusieurs mécanismes (voir [[+tab|https://www.mdpi.com/2079-4991/8/6/447|Bulejko 2018]]): |
- interception par colision sur la fibre | - interception par collision sur la fibre |
- impact direct sur la fibre | - impact direct sur la fibre |
- interception par "Browning motion" avec la fibre | - interception par "Browning motion" avec la fibre |
{{ :labase:medecine-autonomie:nanomaterials-08-00447-g002.jpg?200 |}} | {{ :labase:medecine-autonomie:nanomaterials-08-00447-g002.jpg?200 |}} |
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* Harstad 1965. « [[+tab|https://aem.asm.org/content/13/6/899|Sampling Submicron T1 Bacteriophage Aerosols]] ». Applied Microbiology 13, nᵒ 6 (1 novembre 1965): 899‑908. | * Harstad 1965. Méthode de quantification de virus dans un aérosol par méthode d' "impinger" « [[+tab|https://aem.asm.org/content/13/6/899|Sampling Submicron T1 Bacteriophage Aerosols]] ». Applied Microbiology 13, nᵒ 6 (1 novembre 1965): 899‑908. |
{{ :labase:medecine-autonomie:harstad_-_1965_-_sampling_submicron_t1_bacteriophage_aerosols_-_fig_2.png?200 |}} | {{ :labase:medecine-autonomie:harstad_-_1965_-_sampling_submicron_t1_bacteriophage_aerosols_-_fig_2.png?200 |}} |
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* Milton et al 2013 PLoS Path [[+tab|https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1003205|Influenza Virus Aerosols in Human Exhaled Breath: Particle Size, Culturability, and Effect of Surgical Masks]] : les masques sont particulièrement efficace pour les gouttelettes supérieures à 5 microns | * Milton et al 2013 PLoS Path [[+tab|https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1003205|Influenza Virus Aerosols in Human Exhaled Breath: Particle Size, Culturability, and Effect of Surgical Masks]] : les masques sont particulièrement efficace pour les gouttelettes supérieures à 5 microns |
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| * Makison Booth et al 2013 J Hosp Sc "[[+tab|https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0195670113000698|Effectiveness of surgical masks against influenza bioaerosols]]". Ils trouvent une diminution de 10 fois le nombre de particules virales d'influenza (grippe) et 6 fois pour des particules (Bovine Serum Albumine BSA). {{:labase:medecine-autonomie:booth_et_al_2013_j_hosp_inf_fig_1.png?300 |}}{{:labase:medecine-autonomie:booth_et_al_j_hosp_inf_-_fig_2_testing_rig.png?200 |}} |
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| * Junter & Lebrun 2017. [[+tab|https://doi.org/10.1007/s11157-017-9434-1|Cellulose-Based Virus-Retentive Filters: A Review]]. Reviews in Environmental Science and Bio/Technology 16, nᵒ 3 |
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| ===== Caractéristiques des aérosols etc ===== |
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* Lindsley et al 2016 NIOSH : "[[+tab|https://www.cdc.gov/niosh/nmam/pdf/chapter-ba.pdf|Sampling and characterization of bioaerosols]]" | * Lindsley et al 2016 NIOSH : "[[+tab|https://www.cdc.gov/niosh/nmam/pdf/chapter-ba.pdf|Sampling and characterization of bioaerosols]]" |
* Junter & Lebrun 2017 . [[+tab|https://doi.org/10.1007/s11157-017-9434-1|Cellulose-Based Virus-Retentive Filters: A Review]]. Reviews in Environmental Science and Bio/Technology 16, nᵒ 3 | * |