Le BIB wiki

Cette page est en lecture seule. Vous pouvez afficher le texte source, mais ne pourrez pas le modifier. Contactez votre administrateur si vous pensez qu'il s'agit d'une erreur.
====== Biblio scientifique relative au SARS-cov-2 ======
Biblio essentiellement réalisée de mars 2020 à Mai 2020. Ensuite, on a moins suivi la biblio, désolé...

Voir notre librairie [[+tab|https://www.zotero.org/groups/2462558/bib/library|Zotero]]. Dans les notes de chaque article, nous sommes priés de donner les infos importantes pour nous. Par ex : tests expérimentaux, quels types de virus/bactéries/particules, etc. Si l'article n'a pas d'intérêt, noter "zz-" devant le nom du premier auteur. 

Voir notamment les [[+tab|https://scholar.google.com/scholar?hl=fr&as_sdt=2005&sciodt=0%2C5&cites=14573243267835545576&scipsc=1&q=efficacy&btnG=|articles qui citent Davies et al 2013]]

===== Caractéristiques du SARS-cov-2 =====
  * Survie dans l'air & sur matériels. Voir Van Dormalen et al 2020 NEJM : [[+tab|https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmc2004973|Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1]]. 
{{:labase:medecine-autonomie:van_doremalen_20_nejm_fig1a.jpg?800 |}}\\
\\
\\
\\
\\
  * voir aussi Chin et al 2020 Lancet Microbes et surtout les données supplémentaires de l'article [[+tab|https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214863/|Stability of SARS-CoV-2 in different environmental conditions]]. 

Les auteurs montrent que la stabilité sur différentes [[+tab|https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214863/bin/mmc1.pdf|surfaces]] (Tableau A)
{{:labase:medecine-autonome:chin_et_al_20_lancet_microbes_-_stability_of_sars-cov-2_in_different_environmental_conditions_table_som_b-surf.png?300|}}
\\
mais aussi en fonction de la [[+tab|https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214863/bin/mmc1.pdf|température]] (ce qui montre une déactivation à 70°C pendant 5 minutes): \\
{{:labase:medecine-autonome:chin_et_al_20_lancet_microbes_-_stability_of_sars-cov-2_in_different_environmental_conditions_table_som_a-temp.png?400|}}
\\
et en fonction du [[+tab|https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214863/bin/mmc1.pdf|pH]] (ce qui montre que le virus résiste au vinaigre qui ne sert à rien comme désinfectant !)\\
{{:labase:medecine-autonome:chin_et_al_20_lancet_microbes_-_stability_of_sars-cov-2_in_different_environmental_conditions_tabl_som_d.png?100|}}
\\
et le SARS-Cov2 est sensible aux [[+tab|https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214863/bin/mmc1.pdf|désinfectants]] (ce qui montre que l'eau de javel de maison est bien): \\
{{:labase:medecine-autonome:chin_et_al_20_lancet_microbes_-_stability_of_sars-cov-2_in_different_environmental_conditions_tabl_som_c.png?300|}}

=== Dynamique de l'infection ===
  * Histoire naturelle de la maladie (image très synthétique sortie du documentaire "[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=iVH9GJzkxGs&feature=emb_logo|penser la maladie]] (1)"
{{:labase:medecine-autonomie:capture_du_2020-04-28_13-33-10.jpg?200 |}}

=== Mortalité ===
  * Verity et al 2020 Lancet Inf. Dis. "[[+tab|https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1473309920302437#fig3|Estimates of the severity of coronavirus disease 2019: a model-based analysis]]"
{{:labase:medecine-autonomie:verity_et_al_2020_lancet_inf_dis_-_fig_3_estimates_of_case_fatality_ratio_by_age.jpg?200 |}}
===== Transmission des particules virales =====
Voir la série de présentations youtube de Linsey Marr intitulé "Transmission of Viruses in Droplets and Aerosols" (en anglais)([[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=dD1gKaaQg6k&t=385s|1]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=JaN2PMgBQfI|2]]-[[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=9FqnnTKSAzU|3]]- [[+tab|https://www.youtube.com/watch?v=rCRdtTMHNXE|4]] )

Il existe plusieurs types de modes de transmission des virus : 
  * par vecteurs (types moustiques) -- ce n'est pas le cas du SARScov2 mais plutôt de la Dengue, Zika, Chikiungunia, etc
  * par contact direct (les gens se touchent)
  * par contact indirect (via des objets comme des portes, ballons, etc)
  * par gouttelette (supérieurs à 5 µm) -- portée de 2 mètres
  * par aérosol (gouttelette inférieures à 5 µm) -- portée de plusieurs mètres
La probabilité de transmission de virus aéroportés (gouttellettes ou aérosols) est importante entre 0 et 1,5m : voir l'article de Liu et al 2017 Indoor Air "[[+tab|https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ina.12314?casa_token=hPt_zItdzOEAAAAA%3Alh_3nUFCNDzmGUgOWUGIUxyaAS8KDX89WucYdjLd4qbfxt-I8srEKruLNC7VWU6B8ahGtNbSEuN6i60|Short‐range airborne transmission of expiratory droplets between two people]]"
{{ :labase:medecine-autonomie:liu_et_al_2017_indoor_air_-fig1.jpg?200 |}}

  * Johnson et al 2011 : [[+tab|http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021850211001200|Modality of human expired aerosol size distributions]] : les gouttelettes font une taille de 0.8-1 µm lorsqu'on respire (ou tousse)
{{ :labase:medecine-autonomie:capture_du_2020-04-27_13-19-26.png?200 |}}

La désactivation des virus une fois dans l'atmosphère se fait au cours de trois processus : 
  * dépôt
  * ventilation vers l'extérieur
  * inactivation
La désactivation dépend de la température, ainsi que de l'humidité relative (%RH). Plus la RH est forte, plus les grosse gouttelettes vont rester grosses et plus le dépôt sera fort. Voir les résultats de Yang & Marr 2011 PLoS One "[[+tab|https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0021481|Dynamics of Airborne Influenza A Viruses Indoors and Dependence on Humidity]]"
{{ :labase:medecine-autonomie:yang_marr_2011_plos_one.jpg?200 |}}


===== Efficacité des masques =====



Pour la filtration, il y a plusieurs mécanismes (voir [[+tab|https://www.mdpi.com/2079-4991/8/6/447|Bulejko 2018]]): 
  - interception par collision sur la fibre
  - impact direct sur la fibre
  - interception par "Browning motion" avec la fibre
{{ :labase:medecine-autonomie:nanomaterials-08-00447-g002.jpg?200 |}}

  * Harstad 1965. Méthode de quantification de virus dans un aérosol par méthode d' "impinger" « [[+tab|https://aem.asm.org/content/13/6/899|Sampling Submicron T1 Bacteriophage Aerosols]] ». Applied Microbiology 13, nᵒ 6 (1 novembre 1965): 899‑908.
{{ :labase:medecine-autonomie:harstad_-_1965_-_sampling_submicron_t1_bacteriophage_aerosols_-_fig_2.png?200 |}}

  * Wilkes et al 2000 « [[+tab|https://doi.org/10.1046/j.1365-2044.2000.01327.x.|The Bacterial and Viral Filtration Performance of Breathing System Filters]] ». Anaesthesia 55, nᵒ 5 (2000): 458‑65. 
{{ :labase:medecine-autonomie:wilkes_et_al_2000_fig_1.png?200 |}}
  * Van der Sande, Teunis & Sabel 2008: [[+tab|https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0002618|Professional and Home-Made Face Masks Reduce Exposure to Respiratory Infections among the General Population]] sur l'efficacité des masques faits maison à partir de chiffons en comparaison aux masques normés
{{ :labase:medecine-autonomie:van_de_sande_et_al_2008_plos_one_fig3.png?400 |}}
  * Davies et al 2013 : [[+tab|https://www.cambridge.org/core/journals/disaster-medicine-and-public-health-preparedness/article/testing-the-efficacy-of-homemade-masks-would-they-protect-in-an-influenza-pandemic/0921A05A69A9419C862FA2F35F819D55|Testing the Efficacy of Homemade Masks: Would They Protect in an Influenza Pandemic?]] publié dans Disaster Medicine and Public Health Preparedness. Sur le tableau 1 (ci-dessous) du papier, on voit que l'efficacité des __masques chirurgicaux__ contre les petits virus sont à 89,5%… et l'efficacité des __sacs d'aspirateurs__ sont à 85,9% ! (rappelons nous que les masques FFP2 sont à 94% et FFP3 à 99%). Le soucis, c'est que les auteurs ne donnent AUCUNE références par rapport à ces sacs d'aspirateurs... il faut tester ! 
{{ :labase:capture_du_2020-03-24_16-23-16.png?300 |}}
  * Milton et al 2013 PLoS Path [[+tab|https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1003205|Influenza Virus Aerosols in Human Exhaled Breath: Particle Size, Culturability, and Effect of Surgical Masks]] : les masques sont particulièrement efficace pour les gouttelettes supérieures à 5 microns
{{ :labase:medecine-autonomie:journal.ppat.1003205.g001.jpg?200 |}}
  * Makison Booth et al 2013 J Hosp Sc "[[+tab|https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0195670113000698|Effectiveness of surgical masks against influenza bioaerosols]]". Ils trouvent une diminution de 10 fois le nombre de particules virales d'influenza (grippe) et 6 fois pour des particules (Bovine Serum Albumine BSA). {{:labase:medecine-autonomie:booth_et_al_2013_j_hosp_inf_fig_1.png?300 |}}{{:labase:medecine-autonomie:booth_et_al_j_hosp_inf_-_fig_2_testing_rig.png?200 |}}

\\
\\
\\
\\
\\
\\
\\
  * Junter & Lebrun 2017. [[+tab|https://doi.org/10.1007/s11157-017-9434-1|Cellulose-Based Virus-Retentive Filters: A Review]]. Reviews in Environmental Science and Bio/Technology 16, nᵒ 3 

===== Caractéristiques des aérosols etc =====

  * Lindsley et al 2016 NIOSH : "[[+tab|https://www.cdc.gov/niosh/nmam/pdf/chapter-ba.pdf|Sampling and characterization of bioaerosols]]"
  *
Le BIB wiki

Outils pour utilisateurs

Outils du site

Outils de la page
